Compara os branches locais com os remotos. Caso o branch local (com exceção do branch atual) não estiver listado no repositório remoto, será solicitado a exclusão do branch local.
Caso ainda não tenha o arquivo de perfil do Powershell, basta baixar o arquivp Microsoft.PowerShell_profile.ps1 e colar no diretório C:\Users[seu-usuário]\Documents\WindowsPowerShell.
Depois, ao iniciar o Powershell, dentro da basta de seu projeto Git, basta chamar o comando clean-branches.