Lista de manuscritos para 2021

José Ramón Martínez Batlle

Tw: @geografiard

GH: @geofis

English version below

Mi meta para 2021 o, más bien, para los primeros 6 meses será (además de las clases): escribir y enviar 3 manuscritos. Es la primera vez que "fijo" propósitos. ¿Por qué? La motivación es doble.

1. Porque quiero cambiar el "es un trabajo en curso" por "este es mi aporte". Visualizar muchos de mis "trabajos en curso" me ayudará a concluirlos. No se trata de una competición, se trata de "dar a luz".

2. Porque quiero seguir haciendo ciencia sin proyecto, sin soporte administrativo, sin fondos. Lo he venido haciendo desde hace tiempo, y me parece que es la mejor opción hasta tanto la "burocracia se una a la ciencia".

¿Qué publicaré? Lógicamente, sobre biogeografía y geomorfología, usando software libre, con datos previamente colectados y por colectar, siguiendo criterio de preproducibilidad. Mi lista de deseos de manuscritos, se encuentra aquí.

Prefiero pensar que enviaré manuscritos, y no que publicaré artículos. Además, no prestaré atención al factor de impacto, ni al prestigio ni a la insignia.

¿Qué cosas me importarán? 1) Primero, quiero tener la merecida recompensa de escribir; 2) Segundo, producir conocimiento que quede disponible al público, especialmente para mis estudiantes; 3) Seguir aprendiendo.

Por supuesto, enviaré mi trabajo a revistas, pero con el correspondiente envío a servidores de preprint. Si las revistas quieren publicar mis trabajos, pues bien, pero siempre habrá una copia en servidores de preprint.

¿Cómo lo haré? Mis estudios seguirán cumpliendo los principios de: 1) Preproducibilidad, que significa poderlos reproducir por terceros con scripts provistos por mí como apoyo adicional; 2) Ser realizables en contextos de bajo costo.

Si todo sale bien (y muchas cosas pueden salir mal), a mediados del año próximo pasaré revista a los resultados. Espero mantener el ritmo de redacción hasta final de año; el propósito global es enviar 6 manuscritos. Publicaré actualizaciones aquí mismo.

Creo que preparar propuestas, escribir informes o priorizar la gestión sobre el análisis de datos, impide a los científicos generar conocimiento. Parafraseando a @AcademicsSay: "Deberías estar [analyzing data and] escribiendo".

Relación de manuscritos "reservados" para 2021 (orden aleatorio)

• Asociaciones de comunidades de plantas con variables ambientales en un bosque tropical semideciduo de República Dominicana. Publicado. Preprint

• Pérdida de bosque y fuego en República Dominicana durante el siglo XXI. Preprint. Diapositivas. Vídeo de presentación.

• Medición del tamaño superficial de gravas en una llanura de inundación tropical usando SfM aplicado a imágenes tomadas por drone y machine learning.

• Medición de la deformación superficial en la ciudad de Santo Domingo a partir de small baseline subset (SBAS). Diapositivas. Vídeo de presentación.

• Asociación con variables ambientales de comunidades de plantas en un bosque seco de República Dominicana.

• Medición de la deformación superficial en la cuenca del río Ocoa a partir de small baseline subset (SBAS).

• Cartografía geomorfológica de gran escala de 1 kilómetro de río tropical a partir de SfM e imágenes tomadas por drone. Diapositivas. Vídeo de presentación.

Bonus, no dependen sólo de mí:

• Macroinvertebrados de agua dulce de un río tropical intervenido antrópicamente: asociación con microhábitat.

• Fuego y sequía en República Dominicana durante el siglo XXI.

"Fondo" (2022 y más allá)

• Granulometría de gravas superficiales en la llanura de inundación de un río tropical: ordenación y análisis espacial.

• Cartografía geomorfológica de la cuenca del río Ocoa a partir de SfM y modelos digitales de superficie.

• Morfometría de cuencas en República Dominicana: análisis espacial y multivariado.

• Mapa de cobertura arbórea de un campus universitario a partir de machine learning e imágenes de resolución espacial submétrica.

• Ordenación restringida de comunidades de plantas a partir de datos de GBIF: sesgo, patrones, tendencias.

• Medición de la deformación superficial en el deslizamiento Los Lazos (Azua, República Dominicana) a partir de small baseline subset (SBAS).

• Estimación del porcentaje de cobertura arbórea de bosque semideciduo a partir de imágenes de resolución espacial métrica y submétrica.

• Conteo de árboles de aguacate a partir de redes neuronales e imágenes ópticas de resolución espacial métrica.

• Terrazas del río Ocoa en su zona media-alta: secuencia cronoestratigráfica.

• Caracterización de la morfometría de cañones fluvio-kársticos a partir de SfM y modelos digitales de superficie.

• coastr: paquete de R para crear transectos perpendiculares a la línea de costa.

• Análisis espacial de la granulometría de arena de una playa tropical.

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List of manuscripts for 2021

My goal for 2021 or, rather, for the first 6 months, will be (in addition to teching): to write and send 3 manuscripts. This is the first time I make new year's resolutions. Why? Two reasons motivate me:

1. Because I want to change the "it's a work in progress" for "this is my contribution". Visualizing many of my "works in progress" will make it easier for me to complete them. This is not a competition, it's about "giving birth"

2. Because I want to continue doing science without a project, without staff support and without funding. I've been doing science this way for a while, and I think this is my best choice until bureaucracy meets science.

What will I publish? Obviously, I will write about biogeography and geomorphology, using free software, with data previously collected and to be collected, following preproducibility criteria. My wish list of manuscripts is here.

I prefer to think that I will send manuscripts, not that I will publish articles. In addition, I won't focus on impact factor, prestige or a badge.

What will I care about? 1) First of all, I want to have the well-deserved reward of writing; 2) Secondly, produce knowledge that will available to the public, especially to my students; 3) I want to keep learning.

Obviously, I will send my manuscripts to journals, but I will also make sure to send them to preprint servers. It will be fine if journals publish my work, but the preprint copy will always be there.

How will I do it? My studies will continue to comply with the principles of: 1) Preproducibility, which means reproducibility by third parties with scripts provided by me as an extra help; 2) Being feasible in low-cost contexts.

If everything goes well (and many things could go wrong), by mid-year, I will check the results. I hope to keep up the pace of writing until the end of the year; the overall purpose is to send 6 manuscripts. I will post updates right here.

I think that preparing proposals, writing reports or prioritizing management over data analysis, prevent scientist from generating knowledge. Paraphrasing @AcademicsSay: "You should be [analyzing data and] writing".

List of "reserved" manuscripts for 2021 (randomly sorted)

• Plant community associations with environmental variables in a semi-deciduous tropical forest of the Dominican Republic. Preprint

• Forest loss and fire in the Dominican Republic during the 21st century. Preprint

• Using UAV imagery, SfM and machine learning to measure the surface grain size of gravel deposits in a tropical floodplain.

• Using small baseline subset (SBAS) to measure surface deformation in Santo Domingo city.

• Plant community associations with environmental variables in a dry forest of the Dominican Republic.

• Using small baseline subset (SBAS) to measure surface deformation in Ocoa river basin.

• Using UAV imagery and SfM for small-scale geomorphological mapping of a 1-kilometer tropical river stretch.

Bonus manuscripts, don't depend only on me:

• Freshwater macroinvertebrates of an anthropogenically disturbed tropical river: association with microhabitat.

• Fire and drought in the Dominican Republic during the 21st century.

Pool (2022 and beyond)

• Grain size of surface gravel in a tropical river floodplain: ordination and spatial analysis.

• Using SfM and digital surface models for geomorphological mapping of the Ocoa River basin.

• Basin morphometry in the Dominican Republic: spatial and multivariate analysis.

• Using machine learning and submetric spatial resolution imagery to map tree cover of a university campus.

• Constrained ordination of plant communities from GBIF data: bias, patterns, trends.

• Using small baseline subset (SBAS) to measure surface deformation in Los Lazos landslide (Azua, Dominican Republic).

• Estimation of the percentage of tree cover of semideciduous forest from images of metric and submetric spatial resolution.

• Using neural networks and optical submetric spatial resolution images to count avocado trees.

• Terraces of the Ocoa River in its mid-upper basin: chronostratigraphic sequence.

• Using SfM and digital surface models to characterize karst canyon morphommetry.

• coastr: an R package for creating transects perpendicular to coastline.

• Spatial analysis of grain size in a sandy tropical beach.