Mi familia de plantas asignada es: ...
Elegí la siguiente combinación de temas/preguntas: ...
Por José Ramón Martínez Batlle, el tali
Desde GitHub, en el archivo README.md, sustituye los puntos suspensivos por tus respuestas; instrucciones abajo. No olvides hacer commit al finalizar.
Trabajarás con los datos censales de la parcela permanente (50-Ha) de BCI del Smithsonian Tropical Research Institute (STRI) y con preguntas previamente formuladas por mí.
Paso 1. Mira este vídeo
El vídeo se titula "Barro Colorado: Un vistazo a la ciencia y los científicos que trabajan en la isla de Barro Colorado". Aquí el STRI te explica qué es BCI, su historia, el 50-Ha plot y cómo se realizan estudios de fauna.
Paso 2. Mira este otro vídeo
Lo titulé "Datos censales de la parcela permanente de 50-Ha de árboles en la isla Barro Colorado (BCI)", donde explico:
- Características básicas de los datos.
- Cuáles preguntas podrás seleccionar y responder.
- Un resumen de las técnicas disponibles y qué preguntas responde cada una.
Esto lo harás conmigo. Sin embargo, te dejo algunas notas:
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Cuando tengas familia asignada, investiga un poco sobre ella. Profundizarás a medida que avances en la redacción del manuscrito.
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Mayor riqueza de especies no significa mayor complejidad, y viceversa. Traducción: una familia con gran riqueza de especies no necesariamente es más difícil de trabajar.
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Cuando tengas tu familia asignada, escríbela en el encabezado del repo (sustituye los puntos suspensivos en el lugar correspondiente).
Si ya tienes tu familia de plantas y ya miraste el vídeo "Los datos censales de la parcela permanente de 50-Ha de árboles en la isla Barro Colorado (BCI)", entonces ejecuta este paso.
Las preguntas se clasifican en cinco temas: medición de asociación, agrupamiento, ordenación, ecología espacial, diversidad. Detallo las preguntas que incluye cada tema a continuación:
A. Medición de asociación:
- ¿Se detectan especies asociadas dentro de mi familia seleccionada?
- ¿Existe asociación entre variables ambientales/atributos? ¿Cuáles variables?
B. Agrupamiento (cluster analysis):
- Los cuadros (o quadrats) de 1 hectárea, ¿se organizan en grupos discontinuos según la composición de las especies de mi familia seleccionada?
- Si existe algún patrón, ¿es consistente con alguna variable ambiental/atributo?
- ¿Hay especies indicadoras o con preferencia por determinadas condiciones ambientales/atributos?
C. Diversidad:
- Según los análisis de estimación de riqueza, ¿está suficientemente representada mi familia? Consideremos como buena representación un 85%
- ¿Existe asociación de la diversidad alpha con variables ambientales/atributos? ¿Con cuáles?
- ¿Existe contribución local o por alguna especie a la diversidad beta?
D. Ordenación (ordination analysis):
- En un espacio bidimensional, ¿existen tendencias apreciables de ordenación de las especies de mi familia seleccionada?
- Si existen tendencias de ordenación, ¿se asocian éstas con variables ambientales/atributos?
E. Ecología espacial:
- ¿Alguna(s) especies de mi familia presenta(n) patrón aglomerado? ¿Cuál(es)? ¿Se asocia con alguna variable?
- ¿Predicen bien la ocurrencia de dicha(s) especie(s) los modelos de distribución de especies (SDM)?
A, B y C son temas troncales en ecología numérica que no se pueden obviar, sólo podrás "elegir"" entre combinarlos con ordenación o con ecología espacial. Así, las opciones son éstas:
- ABCD
- ABCE
Antes de elegir, te recomiendo que profundices sobre qué diferencia a ecología espacial de ordenación. Consulta los vídeos que comienzan por to_ y ee_ en esta lista de reproducción.
Tras elegir, escribe tu opción en el encabezado del repo (sustituye los puntos suspensivos en el lugar correspondiente).
Existe un conjunto de técnicas denominadas "análisis exploratorio de datos" (AED) que son prescriptivas, y que verás en la lista de reproducción. No responden preguntas, más bien, ayudan a limpiar los datos.
No olvides hacer commit al finalizar.