diff --git a/Makefile b/Makefile
index 9f3fd7e..e98bd95 100644
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -43,6 +43,8 @@ pr-base.owl: pro_nonreasoned.owl.gz
 		--axioms external \
 		--preserve-structure false \
 		--trim false \
+		remove --select imports \
+		--trim false \
 		--output $@
 
 ppo.owl:
@@ -54,6 +56,8 @@ ppo-base.owl: ppo.owl
 		--axioms external \
 		--preserve-structure false \
 		--trim false \
+		remove --select imports \
+		--trim false \
 		--output $@
 
 po.owl:
@@ -65,6 +69,8 @@ po-base.owl: po.owl
 		--axioms external \
 		--preserve-structure false \
 		--trim false \
+		remove --select imports \
+		--trim false \
 		--output $@
 
 apo.owl:
@@ -76,6 +82,8 @@ apo-base.owl: apo.owl
 		--axioms external \
 		--preserve-structure false \
 		--trim false \
+		remove --select imports \
+		--trim false \
 		--output $@
 
 mmusdv.owl:
@@ -87,6 +95,8 @@ mmusdv-base.owl: mmusdv.owl
 		--axioms external \
 		--preserve-structure false \
 		--trim false \
+		remove --select imports \
+		--trim false \
 		--output $@
 
 foodon.owl:
@@ -99,6 +109,8 @@ foodon-base.owl: foodon.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 to.owl:
@@ -111,6 +123,8 @@ to-base.owl: to.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 peco.owl:
@@ -123,6 +137,8 @@ peco-base.owl: peco.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 mro.owl:
@@ -135,6 +151,8 @@ mro-base.owl: mro.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 hao.owl:
@@ -147,6 +165,8 @@ hao-base.owl: hao.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 clao.owl:
@@ -160,6 +180,8 @@ clao-base.owl: clao.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 oarcs.owl:
@@ -172,6 +194,8 @@ oarcs-base.owl: oarcs.owl
 			--axioms external \
 			--preserve-structure false \
 			--trim false \
+			remove --select imports \
+			--trim false \
 			--output $@
 
 # Passing through RDF/XML to riot is due to https://github.com/INCATools/ubergraph/issues/126